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Yoda est le plus grand Maître Jedi de la saga. Être de petite taille (0,66 m), âgé de plus de 800 ans, c'est un des personnages les plus charismatiques, imposant la sagesse, et le respect auprès des autres Maîtres Jedi. Il est donc un des plus éminents membres du Conseil Jedi, il y joue un rôle capital comme le montre dans l'épisode 1 le refus catégorique à ce que Anakin soit formé en déclarant entre autres qu'il est trop vieux pour cela. Cependant, après la mort de Qui-Gon, il finit par céder et confia sa formation à Obi-Wan Kenobi. Dix ans plus tard, pour contrer la menace de Dark Tyranus, Yoda alla sur Kamino pour prendre livraison effective des forces militaires, créées pour la République, et arriva avec elles sur Géonosis pour sauver Padmé Amidala, Obi-Wan Kenobi et Anakin Skywalker. À l'instant même où l'Armée de clones de la République engagea le combat contre les droïdes séparatistes, la Guerre des clones commença. L'Armée de clones défit les séparatistes sur Géonosis, mais beaucoup s'échappèrent. Yoda suivit alors son instinct pour arriver à un hangar obscur où Dark Tyranus avait gravement blessé Obi-Wan Kenobi et Anakin Skywalker. Yoda affronta donc le Seigneur Sith dans une bataille époustouflante mais ne put l'empêcher de s'échapper. Un peu plus tard, lors de la grande Purge des Jedi menée par Dark Sidious, il réussit à survivre alors que le commandant Gree, qui était l'un de ses plus fidèle officiers, essaya d'ouvrir le feu sur lui. Puis, il alla prêter main-forte à Obi-Wan Kenobi pour neutraliser un piège tendu au Temple Jedi. C'est là que, ayant découvert avec Obi-Wan qu'Anakin Skywalker était devenu l'apprenti de Dark Sidious, Yoda décida de rendre visite à ce dernier tandis qu'Obi-Wan devait trouver et tuer son ancien apprenti. Vaincu après un duel spectaculaire au cours duquel les deux adversaires détruisirent une grande partie du sénat, Yoda s'éclipsa précipitamment dans les profondeurs de l'infrastructure de la chambre du Sénat, dont il sortit en sautant dans un speeder piloté par Bail Organa. Puis, en compagnie de ce dernier et d'Obi-Wan Kenobi, vainqueur d'Anakin Skywalker, il assista à la naissance des enfants de Padmé, Luke et Leia. Alors, Yoda décida d'aller se cacher sur une des planètes du système Dagobah. Trois ans après la bataille de Yavin, Luke Skywalker arriva sur cette planète et finit par faire la connaissance de Yoda. Celui-ci s'occupa de la formation de Luke avec sérieux mais elle fut interrompue par ce dernier qui vit au cours d'une vision que ses amis étaient en danger sur Bespin. Plus tard, Luke revint sur Dagobah pour terminer sa formation mais Yoda était tombé très malade en plus de sa vieillesse et il mourrut, disparaissant physiquement pendant que son corps fusionnait avec la force. Il eut cependant le temps de lui révéler qu'il y a un autre Skywalker, qui n'est autre que Leia, ce que Luke découvrira plus tard.

Mille ans avant la bataille de Yavin, la Confrérie des Sith était dirigée par le Seigneur Dark Bane. Celui-ci est connu nottament pour son caractère impitoyable. Lors de la bataille de Ruusan, il fut empoisonné par son apprentie, la vénéneuse Ghitany. Cependant, Bane n'était pas mort et, ayant assisté à la défaite de son Ordre, il quitta la planète après avoir pris une enfant, Zannah, comme apprentie. Dark Bane se rendit ensuite sur Dxun où se trouvait le tombeau d'un ancien Seigneur Sith : Freedon Nadd. Bane voulant former un nouvel Ordre Sith espérait y trouver des artefacts Sith lui permettant d'en apprendre plus. Alors qu'il entama son atterrissage, il eut la surprise de voir apparaître devant lui le fantôme de son mentor : le Seigneur Qordis. Qordis lui reprocha alors d'avoir abandonné ses frères sur Ruusan et d'avoir fuit comme un lâche. Bien que mort, Qordis était toujours puissant et il fit s'écraser Bane, faisant même exploser son vaisseau pour l'empêcher de quitter la planète. Étant coincé sur Dxun, Bane décida de se rendre à la tombe de Nadd. Étant arrivé, il rencontra des parasites caparaçonnés connus sous le nom d'Orbalisks qui s'accrochèrent à lui. Après avoir découvert leur utilité, Dark Bane subjugua une des bêtes volantes de Dxun pour rejoindre Onderon. Arrivé sur la planète, il alla retrouver Zannah et parti vers un lieu caché pour préparer la destruction de l'Ordre Jedi. Dorénavant il décida qu'il n'y aurait qu'un maître et un apprenti à la fois.

Koon est un Kel Dor membre du Conseil Jedi. Ses origines le contraignent à porter un masque respiratoire, qui lui permet d'évoluer dans une atmosphère riche en oxygène ainsi que des lunettes de protection. Il possède en revanche des organes extrasensoriels particulièrement développés. Dernier Padawan instruit par Maître Tyvokka, un Wookie membre en son temps du Conseil Jedi, Plo Koon accèda alors à son tour au rang de Maître et il est invité à siéger parmi les douze sages placés à la tête de l'Ordre pour s'être brillamment illustré lors de la cinquième bataille de Qotile. S'il aurait aimé y être rejoint par son ami Qui-Gon Jinn, il comprit vite que ce dernier est trop anticonformiste pour se voir accorder cet honneur. Plo Koon décida alors de prendre en charge la jeune Bultar Swan. Après avoir participé à la bataille de Geonosis marquant le début de la Guerre des Clones, Maître Koon fut impliqué dans de nombreux combats. Au cours des derniers mois du conflit, il fut notamment envoyé sur la planète Rendili en compagnie de Saesee Tiin, d'Anakin Skywalker et du capitaine Jan Dodonna (futur général de l'Alliance Rebelle) afin de s'assurer que les forces armées locales continueront à servir la République Galactique. Il prit ensuite le relais d'Obi-Wan Kenobi sur Cato Neimoidia mais lorsque Darth Sidious lance l'Ordre 66 exigeant des clones qu'ils abattent leurs leaders Jedi, le chasseur stellaire de Plo Koon est abattu au-dessus d'une des cités de la planète.

Mace Windu est un Maître Jedi et l'un des derniers membres du Conseil avant la Grande Purge. En plus de sa réputation de sage, Windu est considéré comme l'un des meilleurs combattants au sabre laser de l'Ordre Jedi. Il est même le créateur d'une technique particulière de combat au sabre laser: le vaapad, très dangereuse car très proche du style Sith, qui rapproche dangereusement son utilisateur vers le côté obscur si celui-ci ne peut maîtriser suffisamment ses sentiments. Mace Windu eut pour padawan Echuu Shen-Jon (qui survivra à la purge de l'Ordre 66) et la sage Depa Billaba. Dans les événements qui aboutirent à la bataille de Geonosis, Mace Windu mena un bataillon de Jedi chargé de secourir Obi-Wan Kenobi sur le point d'être exécuté en compagnie d'Anakin Skywalker et de la sénatrice Padmé Amidala sur ordre de Dark Tyranus. Lorsque le groupe se dévoila dans l'arène de Geonosis, Mace Windu descendit affronter Jango Fett et tua le chasseur de primes en lui coupant la tête. Il survécut aux assauts des droïdes séparatistes jusqu'à l'arrivée bienvenue de Maître Yoda en personne, à la tête de l'armée de clones nouvellement réquisitionnée par le Chancelier Palpatine pour défendre la République de la menace Séparatiste. Pendant la Guerre des clones, Maître Windu fut l'un des grands généraux de l'armée de la République et joua un grand rôle dans la défense de Coruscant aux côtés de Maître Yoda. Après le sauvetage du Chancelier Palpatine sur le vaisseau amiral du Général Grievous, il apprit grâce à Anakin Skywalker que le seigneur Sith Dark Sidious n'est autre que le Chancelier en personne. Décidé à arrêter le Seigneur Sith, le maître Jedi se rendit à son bureau accompagné de trois autres Jedi choisis parmi les plus grands bretteurs de l'Ordre, Agen Kolar, Saesee Tiin et Kit Fisto, pour le mettre hors d'état de nuire. Malgré tout, la puissance du Sith fut telle qu'il finit très rapidement seul contre Windu. Mais les capacités du Maître Jedi au combat au sabre-laser sont si exceptionnelles qu'il finit par désarmer Palpatine et le mettre à terre, même si ce dernier a fait duré le combat en attendant l'arrivée d'Anakin. Son duel était sur le point d'être remporté si Anakin Skywalker n'était pas intervenu pour sauver le Sith. Anakin trancha la main de Maître Windu qui, terrassé par la douleur et déstabilisé par sa volte-face, subit la puissance des éclairs de Palpatine de plein fouet et fut projeté à travers la fenêtre du bureau du Chancelier.

Maître Jedi, Agen Kolar était un Zabrak, tout comme son compatriote et frère d'armes Eeth Koth. Pur guerrier, il était très apprécié lorsque les négociations tournaient mal. En compagnie des deux cents autres Jedi réunis par maître Windu, Agen Kolar qui était alors chevalier servit lors de la bataille de Geonosis en compagnie de son padawan Tan Yuster, et n'hésita pas un instant pour porter secours à Obi-Wan Kenobi malgré la présence de Dark Tyranus et de milliers de droïds de combat séparatistes. Si le Zabrak se sortit indemne de cette terrible confrontation, il n'en fut pas de même pour son Padawan qui fut tué dans l'arène sous les yeux de son maître. Après la mort de Tan, le Jedi devint comme plusieurs de ses pairs général des forces de la République et reçut une armée de Clonetroopers. Par la suite, au cours de la guerre des Clones, Agen devint Maître Jedi et obtint même une place parmi le Conseil. Quelques jours après la nomination d'Anakin Skywalker en tant que membre du Conseil Jedi, Agen Kolar, en compagnie de Mace Windu, Kit Fisto et Saesee Tiin se rendirent au bureau de Palpatine pour l'affronter et mettre un terme a son règne. Cependant, les quatre Jedi avaient sous-estimé la nature réelle de Palpatine, alias Dark Sidious, qui les attaqua avec son propre sabre laser, et Agen ne put stopper l'attaque du Sith, qui transperça la poitrine du Zabrak. Ainsi mourut Agen Kolar, la première victime de la Grande Purge Jedi, et pas la dernière.